Sample	total_records	qc_failed	optical_pcr_duplicate	non_primary_hits	unmapped_reads	mapq_lt_mapq_cut_non-unique	mapq_gte_mapq_cut_unique	read_1	read_2	reads_map_to_sense	reads_map_to_antisense	non-splice_reads	splice_reads	reads_mapped_in_proper_pairs	proper-paired_reads_map_to_different_chrom	unique_percent	proper_pairs_percent
7-OE3-15-min-28C	81477918	0	0	5846101	0	3923362	71708455	35857363	35851092	35854607	35853848	49299495	22408960	71700142	0	88.00968011971048	87.99947735532466
7-OE3-15-min-34C	72980673	0	0	5479296	0	3659222	63842155	31923476	31918679	31921360	31920795	43830223	20011932	63836336	0	87.47816699360939	87.47019364976258
7-OE3-30-min-28C	81057646	0	0	5996120	0	4077876	70983650	35494855	35488795	35492087	35491563	48897533	22086117	70972614	0	87.57181278123967	87.55819777939271
7-OE3-30-min-34C	74537524	0	0	5517768	0	3671601	65348155	32677746	32670409	32674487	32673668	44946020	20402135	65339136	0	87.67148610946616	87.65938616367241
7-OE3-45-min-28C	89267116	0	0	6676685	0	4357847	78232584	39119354	39113230	39116523	39116061	53488609	24743975	78219060	0	87.63874930159052	87.62359926582594
7-OE3-45-min-34C	79761304	0	0	5844051	0	3853060	70064193	35034228	35029965	35032246	35031947	47863799	22200394	70055916	0	87.84233642920381	87.83195921671492
7-OE3-75-min-28C	75092841	0	0	5382553	0	3554395	66155893	33079966	33075927	33078192	33077701	45206329	20949564	66150408	0	88.09880158882257	88.09149729732559
7-OE3-75-min-34C	75074275	0	0	5701500	0	3598951	65773824	32889624	32884200	32887051	32886773	45135306	20638518	65764298	0	87.61166724553784	87.59897847831364
7-VF36-15-min-28C	72962801	0	0	5411678	0	3607587	63943536	31974729	31968807	31972044	31971492	43949309	19994227	63933780	0	87.63854337225897	87.62517217506493
7-VF36-15-min-34C	76358278	0	0	5747937	0	3810709	66799632	33402411	33397221	33400206	33399426	45533193	21266439	66793532	0	87.48184708932278	87.47385843352832
7-VF36-30-min-28C	83335378	0	0	6064833	0	4088974	73181571	36593965	36587606	36591151	36590420	50145355	23036216	73173278	0	87.81573055323516	87.8057791974016
7-VF36-30-min-34C	72980195	0	0	5360749	0	3604855	64014591	32010795	32003796	32007691	32006900	43780438	20234153	64005646	0	87.715017752419	87.70276100248842
7-VF36-45-min-28C	74292403	0	0	5567478	0	3618530	65106395	32556529	32549866	32553502	32552893	44615183	20491212	65097410	0	87.63533331934357	87.62323921599359
7-VF36-45-min-34C	69182438	0	0	5096527	0	3201215	60884696	30444173	30440523	30442676	30442020	41694850	19189846	60880020	0	88.0059994416502	87.99924050089129
7-VF36-75-min-28C	67226698	0	0	4964793	0	3218102	59043803	29524149	29519654	29522074	29521729	40521692	18522111	59036154	0	87.82790878707148	87.81653086694813
7-VF36-75-min-34C	78140075	0	0	5595390	0	3578872	68965813	34485821	34479992	34483228	34482585	47277831	21687982	68956962	0	88.25921014281084	88.24788304848697
7-are-15-min-28C	74465971	0	0	5620907	0	3546258	65298806	32651328	32647478	32649710	32649096	44256558	21042248	65294398	0	87.68945751073332	87.6835380283969
7-are-15-min-34C	77918451	0	0	5752114	0	3576322	68590015	34297254	34292761	34295293	34294722	46593653	21996362	68582590	0	88.02794988827486	88.01842069473378
7-are-30-min-28C	65280715	0	0	4821076	0	3015886	57443753	28723254	28720499	28722089	28721664	39006205	18437548	57440486	0	87.9949813662427	87.98997682546829
7-are-30-min-34C	80736603	0	0	6106770	0	3780903	70848930	35426615	35422315	35424835	35424095	47916640	22932290	70843818	0	87.75317187917851	87.7468401785495
7-are-45-min-28C	81601475	0	0	6394582	0	3947743	71259150	35632585	35626565	35629791	35629359	48655307	22603843	71248776	0	87.32581120623126	87.31309820073719
7-are-45-min-34C	75662498	0	0	5963233	0	3623195	66076070	33040158	33035912	33038065	33038005	45121734	20954336	66064546	0	87.33001387292289	87.314783077873
7-are-75-min-28C	77338599	0	0	5856194	0	3624265	67858140	33931212	33926928	33929385	33928755	46198272	21659868	67852216	0	87.74162045526582	87.73396063199955
7-are-75-min-34C	75387107	0	0	5933209	0	3667258	65786640	32896514	32890126	32893530	32893110	44970420	20816220	65774696	0	87.26510754683822	87.24926398886748
8-OE3-15-min-28C	66768653	0	0	5043691	0	3205437	58519525	29261861	29257664	29260029	29259496	39990107	18529418	58514664	0	87.64520829857089	87.6379279360331
8-OE3-15-min-34C	75843266	0	0	5760511	0	3660613	66422142	33211904	33210238	33211032	33211110	45430166	20991976	66407766	0	87.57816679466309	87.55921191474006
8-OE3-30-min-28C	67130063	0	0	4981810	0	3213636	58934617	29469040	29465577	29467594	29467023	40256898	18677719	58930350	0	87.79169028934174	87.78533397175569
8-OE3-30-min-34C	82139743	0	0	5940568	0	3924163	72275012	36140456	36134556	36137939	36137073	49285299	22989713	72267892	0	87.99030695774151	87.98163880303352
8-OE3-45-min-28C	85613790	0	0	6250503	0	4103573	75259714	37633183	37626531	37630257	37629457	51669146	23590568	75251456	0	87.90606513273154	87.8964194903648
8-OE3-45-min-34C	78604019	0	0	6054501	0	3870640	68678878	34341017	34337861	34339529	34339349	47155651	21523227	68662856	0	87.37323978307012	87.35285660139083
8-OE3-75-min-28C	82028780	0	0	6088366	0	4002344	71938070	35972241	35965829	35969376	35968694	49275642	22662428	71928068	0	87.69857359819322	87.686380316762
8-OE3-75-min-34C	71832411	0	0	5146005	0	3374205	63312201	31658668	31653533	31656486	31655715	43247967	20064234	63305988	0	88.1387664963661	88.13011719737487
8-VF36-15-min-28C	77942788	0	0	5590855	0	3737643	68614290	34310330	34303960	34307482	34306808	47099887	21514403	68605788	0	88.03160851777588	88.0207005168971
8-VF36-15-min-34C	70129667	0	0	5147669	0	3363182	61618816	30811055	30807761	30809676	30809140	42259271	19359545	61614358	0	87.86412175606081	87.85776495987069
8-VF36-30-min-28C	74978412	0	0	5625149	0	3617282	65735981	32868535	32867446	32867533	32868448	44987946	20748035	65720100	0	87.67321052358378	87.65202976024618
8-VF36-30-min-34C	92581037	0	0	6816612	0	4548181	81216244	40611214	40605030	40608405	40607839	55768856	25447388	81206580	0	87.72449157163794	87.71405314891861
8-VF36-45-min-28C	80847488	0	0	6015536	0	3941744	70890208	35447390	35442818	35445229	35444979	48867207	22023001	70877884	0	87.68387213218053	87.66862861589466
8-VF36-45-min-34C	73720168	0	0	5324113	0	3558629	64837426	32420994	32416432	32418907	32418519	44511931	20325495	64829898	0	87.95073011770673	87.94051852947487
8-VF36-75-min-28C	79209168	0	0	6219525	0	4083111	68906532	34454316	34452216	34453012	34453520	47698197	21208335	68888130	0	86.99312685622452	86.9698946970381
8-VF36-75-min-34C	72474097	0	0	5386293	0	3543924	63543880	31774967	31768913	31772130	31771750	43580063	19963817	63533772	0	87.67805689251982	87.66410984051308
8-are-15-min-28C	76190086	0	0	5769882	0	3661289	66758915	33382141	33376774	33379745	33379170	45558283	21200632	66752352	0	87.62152466923321	87.61291068761886
8-are-15-min-34C	74425830	0	0	5293500	0	3507367	65624963	32814973	32809990	32812768	32812195	44821948	20803015	65618916	0	88.17498306703466	88.16685819963311
8-are-30-min-28C	69091458	0	0	4974837	0	3258739	60857882	30430830	30427052	30429222	30428660	41511869	19346013	60853242	0	88.08307678208209	88.07636104596315
8-are-30-min-34C	67798603	0	0	4984382	0	3167951	59646270	29826400	29819870	29823511	29822759	40544183	19102087	59637370	0	87.97566227138928	87.96253515725095
8-are-45-min-28C	75103982	0	0	5889154	0	3695912	65518916	32762282	32756634	32759825	32759091	44901527	20617389	65509778	0	87.23760612320129	87.2254389920364
8-are-45-min-34C	68299508	0	0	4966218	0	3269443	60063847	30033619	30030228	30032176	30031671	41192267	18871580	60059320	0	87.94184432485224	87.93521616583241
8-are-75-min-28C	69782546	0	0	5100765	0	3342662	61339119	30671221	30667898	30669874	30669245	42161671	19177448	61334672	0	87.90037411360714	87.89400145990662
8-are-75-min-34C	84164545	0	0	6358661	0	4085323	73720561	36862782	36857779	36860580	36859981	50560462	23160099	73713500	0	87.5909933333567	87.5826038149437
9-OE3-15-min-28C	69548605	0	0	5014732	0	3252524	61281349	30643228	30638121	30640905	30640444	41899634	19381715	61272698	0	88.1129808426783	88.10054205975807
9-OE3-15-min-34C	75513460	0	0	5711285	0	3629471	66172704	33088211	33084493	33086714	33085990	45175053	20997651	66168358	0	87.63034298785938	87.62458772250669
9-OE3-30-min-28C	70707380	0	0	5097073	0	3336310	62273997	31139340	31134657	31137200	31136797	42568415	19705582	62266252	0	88.07283907280966	88.06188547786667
9-OE3-30-min-34C	58869879	0	0	4372364	0	2761031	51736484	25869976	25866508	25868504	25867980	35295625	16440859	51732552	0	87.88277618168708	87.87609704446649
9-OE3-45-min-28C	92054757	0	0	6875006	0	4476986	80702765	40354605	40348160	40351689	40351076	55282005	25420760	80692342	0	87.66821794988824	87.6568953411066
9-OE3-45-min-34C	94558022	0	0	7058684	0	4583735	82915603	41460253	41455350	41458191	41457412	56742747	26172856	82906610	0	87.68753961456596	87.67802905183444
9-OE3-75-min-28C	88806096	0	0	6694654	0	4344663	77766779	38885661	38881118	38883613	38883166	53263402	24503377	77758424	0	87.56919007001501	87.55978193208719
9-OE3-75-min-34C	93333910	0	0	6930619	0	4492018	81911273	40958928	40952345	40955825	40955448	56023758	25887515	81901242	0	87.76153597336702	87.75078853977081
9-VF36-15-min-28C	79035041	0	0	5917747	0	3917935	69199359	34603276	34596083	34599983	34599376	47575146	21624213	69185680	0	87.55528955821002	87.53798204520447
9-VF36-15-min-34C	74506600	0	0	5544800	0	3607426	65354374	32679707	32674667	32677500	32676874	44680847	20673527	65348180	0	87.71622111329734	87.70790775582297
9-VF36-30-min-28C	94195972	0	0	6886410	0	4542116	82767446	41387597	41379849	41384106	41383340	56652092	26115354	82757476	0	87.86728799825963	87.85670368155445
9-VF36-30-min-34C	73161909	0	0	5395202	0	3480175	64286532	32145499	32141033	32143574	32142958	43873803	20412729	64281552	0	87.8688553629731	87.86204854222707
9-VF36-45-min-28C	77622428	0	0	5771402	0	3722188	68128838	34067563	34061275	34064578	34064260	46753258	21375580	68116722	0	87.76952712687627	87.75391823610568
9-VF36-45-min-34C	75134238	0	0	5655973	0	3673857	65804408	32903938	32900470	32902433	32901975	45063096	20741312	65796898	0	87.5824520906168	87.57245664752732
9-VF36-75-min-28C	77481362	0	0	5885593	0	3789924	67805845	33905234	33900611	33903086	33902759	46470950	21334895	67796938	0	87.51245880267308	87.50096313485042
9-VF36-75-min-34C	88257591	0	0	6696456	0	4359872	77201263	38603580	38597683	38600890	38600373	52771107	24430156	77190982	0	87.47266056695338	87.4610117105961
9-are-15-min-28C	88260182	0	0	6823786	0	4217672	77218724	38613100	38605624	38609705	38609019	52442457	24776267	77209116	0	87.48987623886839	87.47899024273482
9-are-15-min-34C	73629362	0	0	5477391	0	3389357	64762614	32383509	32379105	32381577	32381037	44062731	20699883	64756190	0	87.95759224424626	87.94886746404241
9-are-30-min-28C	71110859	0	0	5344001	0	3298145	62468713	31236670	31232043	31234616	31234097	42487411	19981302	62462528	0	87.84693910110128	87.83824141401526
9-are-30-min-34C	80778213	0	0	6160631	0	3803160	70814422	35410631	35403791	35407630	35406792	48096292	22718130	70805124	0	87.66524953950145	87.65373901004719
9-are-45-min-28C	89481073	0	0	7418696	0	4646751	77415626	38712261	38703365	38708164	38707462	53314663	24100963	77400644	0	86.51620214701717	86.49945894144564
9-are-45-min-34C	89936296	0	0	7033014	0	4552986	78350296	39177906	39172390	39175497	39174799	53822279	24528017	78340970	0	87.11754818099247	87.10717861896381
9-are-75-min-28C	87795095	0	0	6963576	0	4454107	76377412	38192102	38185310	38189150	38188262	52365734	24011678	76367102	0	86.99507871140182	86.98333545854697
9-are-75-min-34C	80910340	0	0	6553926	0	4175862	70180552	35093700	35086852	35090765	35089787	47804424	22376128	70169868	0	86.73866900077294	86.72546426081018