Sample	r_processed	r_with_adapters	r_written	bp_processed	quality_trimmed	bp_written	percent_trimmed
7-OE3-15-min-28C_1	38602235	15222500	38602235	5790335250	2783867	5671503622	2.052240895723611
7-OE3-15-min-28C_2	38602235	15706121	38602235	5790335250	9215026	5692016694	1.697976917657747
7-OE3-15-min-34C_1	34331406	13449030	34331406	5149710900	2198986	5057805877	1.784663737142992
7-OE3-15-min-34C_2	34331406	13966307	34331406	5149710900	7635710	5065407053	1.6370598007744475
7-OE3-30-min-28C_1	38234998	14813758	38234998	5735249700	3442832	5645735076	1.5607798907168768
7-OE3-30-min-28C_2	38234998	15336724	38234998	5735249700	10085579	5650521363	1.477326035168094
7-OE3-30-min-34C_1	35200443	13575786	35200443	5280066450	2442751	5192623391	1.6560976993007352
7-OE3-30-min-34C_2	35200443	14040909	35200443	5280066450	9840183	5200744526	1.502290260002315
7-OE3-45-min-28C_1	42139378	16317784	42139378	6320906700	4037726	6234174566	1.3721470370698559
7-OE3-45-min-28C_2	42139378	17013775	42139378	6320906700	10259183	6233062203	1.3897451927268598
7-OE3-45-min-34C_1	37521209	14632097	37521209	5628181350	3113526	5545684339	1.4657845202518216
7-OE3-45-min-34C_2	37521209	15275388	37521209	5628181350	7725416	5545387584	1.4710571826190355
7-OE3-75-min-28C_1	35378015	13948457	35378015	5306702250	2544567	5216462663	1.7004833274751754
7-OE3-75-min-28C_2	35378015	14547291	35378015	5306702250	6201671	5224301204	1.552773118182766
7-OE3-75-min-34C_1	37594977	15117920	37594977	5639246550	3611132	5534565950	1.8562869892610034
7-OE3-75-min-34C_2	37594977	15800584	37594977	5639246550	8383481	5533057762	1.883031484055259
7-VF36-15-min-28C_1	34461538	13615133	34461538	5169230700	2979308	5072076016	1.8794805192192332
7-VF36-15-min-28C_2	34461538	14046339	34461538	5169230700	8495671	5085666141	1.616576311829147
7-VF36-15-min-34C_1	35857981	13706345	35857981	5378697150	2146261	5304230122	1.3844807752375499
7-VF36-15-min-34C_2	35857981	14309699	35857981	5378697150	7310935	5306143083	1.348915266590163
7-VF36-30-min-28C_1	39286662	15333361	39286662	5892999300	2690489	5803095167	1.5256090900944108
7-VF36-30-min-28C_2	39286662	15907038	39286662	5892999300	8878379	5805803698	1.4796472485581322
7-VF36-30-min-34C_1	34378537	13295115	34378537	5156780550	2366425	5085312094	1.3859123014261292
7-VF36-30-min-34C_2	34378537	13794894	34378537	5156780550	8937875	5084076074	1.4098811321338853
7-VF36-45-min-28C_1	34922913	13595822	34922913	5238436950	2930183	5161825816	1.462480788281703
7-VF36-45-min-28C_2	34922913	14199889	34922913	5238436950	8497189	5159801740	1.5011197185450518
7-VF36-45-min-34C_1	32483388	12725467	32483388	4872508200	2639817	4796298982	1.5640654642715635
7-VF36-45-min-34C_2	32483388	13360135	32483388	4872508200	5873941	4795004242	1.5906378156531373
7-VF36-75-min-28C_1	32081494	12427067	32081494	4812224100	2843527	4737461812	1.5535911554908677
7-VF36-75-min-28C_2	32081494	13003410	32081494	4812224100	6791350	4741846684	1.4624717082481675
7-VF36-75-min-34C_1	36860062	14408969	36860062	5529009300	3401637	5444935476	1.5205947293306235
7-VF36-75-min-34C_2	36860062	15045017	36860062	5529009300	8717925	5442867405	1.557998735867563
7-are-15-min-28C_1	35015624	14088109	35015624	5252343600	2025245	5146841829	2.0086608766418097
7-are-15-min-28C_2	35015624	14599607	35015624	5252343600	6024765	5158403528	1.7885363021566218
7-are-15-min-34C_1	36690947	14320658	36690947	5503642050	2597718	5419551999	1.527898257845457
7-are-15-min-34C_2	36690947	14894637	36690947	5503642050	7653900	5420715571	1.506756403243921
7-are-30-min-28C_1	30748073	12452597	30748073	4612210950	1806343	4513764157	2.134481576563622
7-are-30-min-28C_2	30748073	12920851	30748073	4612210950	4817378	4526872858	1.8502642859386125
7-are-30-min-34C_1	37962324	15311592	37962324	5694348600	2241859	5583132125	1.9531026779779515
7-are-30-min-34C_2	37962324	15885533	37962324	5694348600	6558360	5592385673	1.79059861210464
7-are-45-min-28C_1	38385363	15381260	38385363	5757804450	3625746	5637947514	2.0816430471166836
7-are-45-min-28C_2	38385363	15911153	38385363	5757804450	8584310	5653972565	1.8033242688539033
7-are-45-min-34C_1	35402900	13719680	35402900	5310435000	3642264	5237146402	1.380086527751493
7-are-45-min-34C_2	35402900	14351504	35402900	5310435000	8059091	5236046239	1.4008035311608182
7-are-75-min-28C_1	36283873	14261621	36283873	5442580950	2622507	5352365927	1.6575779731856815
7-are-75-min-28C_2	36283873	14832825	36283873	5442580950	6691533	5358241179	1.549628232906669
7-are-75-min-34C_1	35304867	13616103	35304867	5295730050	3341816	5223233435	1.3689635671667213
7-are-75-min-34C_2	35304867	14202014	35304867	5295730050	9068153	5222113989	1.3901022201839763
8-OE3-15-min-28C_1	32431959	13175417	32431959	4864793850	2698843	4761105979	2.13139290578572
8-OE3-15-min-28C_2	32431959	13684965	32431959	4864793850	5870368	4771051420	1.9269558565158933
8-OE3-15-min-34C_1	35729015	13912058	35729015	5359352250	4860926	5280308558	1.4748739831385407
8-OE3-15-min-34C_2	35729015	14478585	35729015	5359352250	8598403	5282308625	1.4375547903200427
8-OE3-30-min-28C_1	31537046	12787222	31537046	4730556900	2522501	4634443459	2.0317574237401095
8-OE3-30-min-28C_2	31537046	13288434	31537046	4730556900	5122249	4645317487	1.8018896041605585
8-OE3-30-min-34C_1	38655853	15216357	38655853	5798377950	2992259	5706054441	1.5922299269919098
8-OE3-30-min-34C_2	38655853	15827416	38655853	5798377950	7948644	5706642278	1.5820919710830508
8-OE3-45-min-28C_1	40495819	16313677	40495819	6074372850	2681893	5932356460	2.337959712170121
8-OE3-45-min-28C_2	40495819	16777986	40495819	6074372850	8011730	5963746301	1.8212011631785165
8-OE3-45-min-34C_1	36946571	14189111	36946571	5541985650	5040777	5465138544	1.3866348787821203
8-OE3-45-min-34C_2	36946571	14876398	36946571	5541985650	8773520	5469535608	1.3072939299292483
8-OE3-75-min-28C_1	38591820	14800948	38591820	5788773000	2900821	5708613432	1.3847419479050223
8-OE3-75-min-28C_2	38591820	15406932	38591820	5788773000	8425194	5713166188	1.306093916621018
8-OE3-75-min-34C_1	33915531	13363743	33915531	5087329650	2057940	5002488537	1.6676944258959117
8-OE3-75-min-34C_2	33915531	13897999	33915531	5087329650	6458863	5009680734	1.5263197264993433
8-VF36-15-min-28C_1	36846658	14249662	36846658	5526998700	2542474	5442114263	1.535814310938774
8-VF36-15-min-28C_2	36846658	14800508	36846658	5526998700	9257897	5445383043	1.4766722669936578
8-VF36-15-min-34C_1	33058202	13206165	33058202	4958730300	2140490	4859494754	2.0012289436269604
8-VF36-15-min-34C_2	33058202	13706330	33058202	4958730300	6498243	4868661471	1.8163687789190714
8-VF36-30-min-28C_1	35389861	13653045	35389861	5308479150	5201447	5230611856	1.4668475056551742
8-VF36-30-min-28C_2	35389861	14198024	35389861	5308479150	9209454	5235245146	1.3795665751084283
8-VF36-30-min-34C_1	43685475	17037503	43685475	6552821250	3260187	6445382918	1.63957367217975
8-VF36-30-min-34C_2	43685475	17658997	43685475	6552821250	10556041	6450854910	1.5560677776766763
8-VF36-45-min-28C_1	38278919	15048115	38278919	5741837850	4001487	5646524320	1.659982961727141
8-VF36-45-min-28C_2	38278919	15720021	38278919	5741837850	9278261	5651089765	1.580471050745538
8-VF36-45-min-34C_1	34865413	13415375	34865413	5229811950	2565042	5155166663	1.4273034616474116
8-VF36-45-min-34C_2	34865413	14043432	34865413	5229811950	7560079	5156286424	1.4058923476206444
8-VF36-75-min-28C_1	37332433	14105733	37332433	5599864950	6182674	5526458477	1.3108614878292735
8-VF36-75-min-28C_2	37332433	14772955	37332433	5599864950	10794376	5530640610	1.2361787403462292
8-VF36-75-min-34C_1	34138487	13083353	34138487	5120773050	2756546	5050650149	1.369381152324257
8-VF36-75-min-34C_2	34138487	13661053	34138487	5120773050	9044893	5049073479	1.4001708394399552
8-are-15-min-28C_1	35909920	14492971	35909920	5386488000	3195600	5264041606	2.273213901154147
8-are-15-min-28C_2	35909920	14934255	35909920	5386488000	7260053	5284948676	1.8850747277261177
8-are-15-min-34C_1	35090134	13886096	35090134	5263520100	2656573	5171354615	1.751023711299212
8-are-15-min-34C_2	35090134	14436140	35090134	5263520100	6683605	5179988761	1.5869862261948995
8-are-30-min-28C_1	32591180	13167562	32591180	4888677000	2691911	4786884376	2.0822120995107674
8-are-30-min-28C_2	32591180	13624975	32591180	4888677000	5752302	4799581799	1.8224808266121897
8-are-30-min-34C_1	31882760	12624745	31882760	4782414000	2669656	4708508327	1.5453633457914768
8-are-30-min-34C_2	31882760	13149022	31882760	4782414000	7875271	4705628126	1.605588182035265
8-are-45-min-28C_1	35264543	13898067	35264543	5289681450	2606110	5203679445	1.6258446905153427
8-are-45-min-28C_2	35264543	14585213	35264543	5289681450	8021037	5203340591	1.632250633920498
8-are-45-min-34C_1	32184551	12713520	32184551	4827682650	2022457	4738653092	1.8441468599846762
8-are-45-min-34C_2	32184551	13267324	32184551	4827682650	6110035	4744064797	1.73204949583834
8-are-75-min-28C_1	32896475	13063769	32896475	4934471250	2061663	4838297021	1.9490280544242709
8-are-75-min-28C_2	32896475	13618346	32896475	4934471250	6107593	4850398013	1.703794241378952
8-are-75-min-34C_1	39519909	15370024	39519909	5927986350	2612049	5838139182	1.5156439757996405
8-are-75-min-34C_2	39519909	16097360	39519909	5927986350	8196127	5837709376	1.522894431091259
9-OE3-15-min-28C_1	32859307	12659608	32859307	4928896050	2950502	4855902000	1.4809411531411787
9-OE3-15-min-28C_2	32859307	13213213	32859307	4928896050	7715546	4859688585	1.4041169523143018
9-OE3-15-min-34C_1	35452553	14329811	35452553	5317882950	3124777	5212245461	1.9864575808311087
9-OE3-15-min-34C_2	35452553	14963911	35452553	5317882950	5823645	5219236867	1.8549878575270258
9-OE3-30-min-28C_1	33319276	12806719	33319276	4997891400	2856108	4930292236	1.3525536789374815
9-OE3-30-min-28C_2	33319276	13372414	33319276	4997891400	7642535	4929579476	1.3668148931767505
9-OE3-30-min-34C_1	28465690	11577578	28465690	4269853500	2611329	4177201441	2.169911895103661
9-OE3-30-min-34C_2	28465690	12042032	28465690	4269853500	5084366	4186670285	1.9481514998114104
9-OE3-45-min-28C_1	43545511	17023010	43545511	6531826650	3154212	6436711003	1.4561875581924697
9-OE3-45-min-28C_2	43545511	17741704	43545511	6531826650	9695339	6434927648	1.4834901045636293
9-OE3-45-min-34C_1	44406374	17500100	44406374	6660956100	3178962	6560691928	1.505251956246942
9-OE3-45-min-34C_2	44406374	18266701	44406374	6660956100	9250410	6558946607	1.5314542157093634
9-OE3-75-min-28C_1	41987821	16841073	41987821	6298173150	3038415	6186513010	1.7728972726003889
9-OE3-75-min-28C_2	41987821	17536520	41987821	6298173150	8037243	6192608774	1.6761110481695791
9-OE3-75-min-34C_1	43902605	17165692	43902605	6585390750	3077772	6492740034	1.4069129610873887
9-OE3-75-min-34C_2	43902605	17887241	43902605	6585390750	10044823	6489317113	1.458890453842849
9-VF36-15-min-28C_1	37716606	14899686	37716606	5657490900	4182165	5557487029	1.767636444629544
9-VF36-15-min-28C_2	37716606	15439314	37716606	5657490900	9915217	5566465617	1.6089337943080033
9-VF36-15-min-34C_1	35413064	14090302	35413064	5311959600	2634180	5208558182	1.9465776433992457
9-VF36-15-min-34C_2	35413064	14583558	35413064	5311959600	6990388	5225158404	1.6340710874382405
9-VF36-30-min-28C_1	44728702	17713292	44728702	6709305300	3525934	6592139287	1.7463210833467364
9-VF36-30-min-28C_2	44728702	18308157	44728702	6709305300	10387426	6599397582	1.6381385715149972
9-VF36-30-min-34C_1	34732934	13993311	34732934	5209940100	2607752	5101868444	2.074335864245349
9-VF36-30-min-34C_2	34732934	14482513	34732934	5209940100	6627073	5116347683	1.796420212201672
9-VF36-45-min-28C_1	36688445	14224893	36688445	5503266750	3165159	5426177973	1.4007821263615832
9-VF36-45-min-28C_2	36688445	14827800	36688445	5503266750	8742086	5426543277	1.3941441780920396
9-VF36-45-min-34C_1	35350603	13797487	35350603	5302590450	2607130	5225057698	1.462167458171317
9-VF36-45-min-34C_2	35350603	14424821	35350603	5302590450	6554050	5224867378	1.465756647300566
9-VF36-75-min-28C_1	36782602	14669558	36782602	5517390300	2784825	5414085620	1.8723467868495727
9-VF36-75-min-28C_2	36782602	15220330	36782602	5517390300	6887143	5429051248	1.6011021007522344
9-VF36-75-min-34C_1	41410678	16136561	41410678	6211601700	3086690	6127172350	1.3592202796905024
9-VF36-75-min-34C_2	41410678	16832680	41410678	6211601700	8623496	6124095108	1.4087605134115408
9-are-15-min-28C_1	41693475	16216559	41693475	6254021250	3091729	6158334761	1.5299994223716462
9-are-15-min-28C_2	41693475	16833004	41693475	6254021250	9592716	6162759225	1.4592535162876206
9-are-15-min-34C_1	34909887	13896004	34909887	5236483050	2783032	5143075082	1.7837920434021077
9-are-15-min-34C_2	34909887	14419075	34909887	5236483050	7004695	5147279384	1.703503384776544
9-are-30-min-28C_1	33678870	13387925	33678870	5051830500	2563260	4956344819	1.8901204424811957
9-are-30-min-28C_2	33678870	13878191	33678870	5051830500	6535956	4968539469	1.6487297228202729
9-are-30-min-34C_1	38241489	15050259	38241489	5736223350	3104017	5646738356	1.5599984264908373
9-are-30-min-34C_2	38241489	15622519	38241489	5736223350	9132514	5645233384	1.5862347131235748
9-are-45-min-28C_1	42666978	16702620	42666978	6400046700	3953749	6293150898	1.6702347187560367
9-are-45-min-28C_2	42666978	17461155	42666978	6400046700	10871499	6301103529	1.5459757660830817
9-are-45-min-34C_1	42053858	16638840	42053858	6308078700	3035181	6211013955	1.5387370642664937
9-are-45-min-34C_2	42053858	17407053	42053858	6308078700	8712658	6209007115	1.5705508715355754
9-are-75-min-28C_1	41054427	16160203	41054427	6158164050	3039786	6065499069	1.5047501211014345
9-are-75-min-28C_2	41054427	16888925	41054427	6158164050	9248598	6062768746	1.5490867606880332
9-are-75-min-34C_1	37899477	14700648	37899477	5684921550	2674705	5604077498	1.4220785861152296
9-are-75-min-34C_2	37899477	15440137	37899477	5684921550	8836645	5602210116	1.4549265679840384