Sample	r_processed	r_with_adapters	r_written	bp_processed	quality_trimmed	bp_written	percent_trimmed
Heinz-Ovary-Rep1-0hr-25C-unpol_1	26376937	10887672	26376937	3956540550	8653045	3848662869	2.726565787377056
Heinz-Ovary-Rep1-0hr-25C-unpol_2	26376937	11357405	26376937	3956540550	17052747	3857106623	2.5131532393873734
Heinz-Ovary-Rep2-0hr-25C-unpol_1	22249582	9557778	22249582	3337437300	4643637	3201488372	4.073452645836972
Heinz-Ovary-Rep2-0hr-25C-unpol_2	22249582	9622609	22249582	3337437300	5867867	3248165352	2.6748651727479644
Heinz-Ovary-Rep3-0hr-25C-unpol_1	25896957	10866057	25896957	3884543550	6658742	3785901656	2.539343238924429
Heinz-Ovary-Rep3-0hr-25C-unpol_2	25896957	11288328	25896957	3884543550	14753532	3791549519	2.3939500176281974
Heinz-Rep1-0hr-25C-self_1	28482673	12667117	28482673	4272400950	13615633	4076193636	4.592436812373614
Heinz-Rep1-0hr-25C-self_2	28482673	12924349	28482673	4272400950	22647438	4079013896	4.526425685772774
Heinz-Rep1-3hr-25C-self_1	25665497	11244977	25665497	3849824550	10413900	3704207871	3.782423773052203
Heinz-Rep1-3hr-25C-self_2	25665497	11478083	25665497	3849824550	15167087	3744549532	2.7345406688728193
Heinz-Rep1-3hr-37C-self_1	26363270	10757508	26363270	3954490500	8516347	3852368646	2.582427597183506
Heinz-Rep1-3hr-37C-self_2	26363270	11027173	26363270	3954490500	16919122	3866390467	2.227847885840161
Heinz-Rep1-8hr-25C-self_1	25884247	12857927	25884247	3882637050	12475357	3600499034	7.266659550369252
Heinz-Rep1-8hr-25C-self_2	25884247	12964083	25884247	3882637050	14175783	3603190820	7.197330742001753
Heinz-Rep1-8hr-37C-self_1	26059831	11289704	26059831	3908974650	8439064	3783499639	3.2099213280904753
Heinz-Rep1-8hr-37C-self_2	26059831	11538330	26059831	3908974650	15741816	3796382498	2.8803500171074274
Heinz-Rep2-0hr-25C-self_1	26332724	11841614	26332724	3949908600	9633035	3801733088	3.7513655885607076
Heinz-Rep2-0hr-25C-self_2	26332724	12149536	26332724	3949908600	17053937	3812753348	3.472365208653182
Heinz-Rep2-3hr-25C-self_1	25853265	10911524	25853265	3877989750	6543416	3783354294	2.4403224892484565
Heinz-Rep2-3hr-25C-self_2	25853265	11246790	25853265	3877989750	14757518	3786945038	2.3477295678772747
Heinz-Rep2-3hr-37C-self_1	27837318	11716801	27837318	4175597700	10757271	4056889400	2.842905579720958
Heinz-Rep2-3hr-37C-self_2	27837318	12061524	27837318	4175597700	22018387	4062875674	2.6995422954658683
Heinz-Rep2-8hr-25C-self_1	24813184	11048790	24813184	3721977600	10384034	3536688028	4.978255968010124
Heinz-Rep2-8hr-25C-self_2	24813184	11036081	24813184	3721977600	12370819	3569760842	4.089674209753438
Heinz-Rep2-8hr-37C-self_1	26388363	11252151	26388363	3958254450	10347139	3836616130	3.073029324832819
Heinz-Rep2-8hr-37C-self_2	26388363	11493914	26388363	3958254450	18283106	3852779755	2.6646769764889675
Heinz-Rep3-0hr-25C-self_1	26541689	11085047	26541689	3981253350	8362044	3884363052	2.433663208095009
Heinz-Rep3-0hr-25C-self_2	26541689	11419029	26541689	3981253350	16770770	3891084776	2.2648288383857813
Heinz-Rep3-3hr-25C-self_1	23800315	9840238	23800315	3570047250	4712024	3476440908	2.6219916837235138
Heinz-Rep3-3hr-25C-self_2	23800315	9993132	23800315	3570047250	5739807	3510836439	1.6585441831337107
Heinz-Rep3-3hr-37C-self_1	25578129	10911325	25578129	3836719350	7655371	3722216102	2.9844051011966775
Heinz-Rep3-3hr-37C-self_2	25578129	11178503	25578129	3836719350	14143296	3740623340	2.504640064434215
Heinz-Rep3-8hr-25C-self_1	25584627	11524030	25584627	3837694050	10110974	3681868621	4.060392177432695
Heinz-Rep3-8hr-25C-self_2	25584627	11700317	25584627	3837694050	16245697	3709205883	3.3480565497398107
Heinz-Rep3-8hr-37C-self_1	26073810	11092641	26073810	3911071500	7392852	3806264459	2.6797526202218496
Heinz-Rep3-8hr-37C-self_2	26073810	11387580	26073810	3911071500	15613596	3812408692	2.522654162676392
Malintka-Rep1-0hr-25C-self_1	26405032	11598943	26405032	3960754800	8389926	3832586904	3.2359462393380176
Malintka-Rep1-0hr-25C-self_2	26405032	11925004	26405032	3960754800	15544903	3830506891	3.2884618103599847
Malintka-Rep1-3hr-25C-self_1	25079992	11215928	25079992	3761998800	9604566	3572840366	5.028136478937739
Malintka-Rep1-3hr-25C-self_2	25079992	11428751	25079992	3761998800	9842580	3572179500	5.0457033638607225
Malintka-Rep1-3hr-37C-self_1	26281254	12336118	26281254	3942188100	9131534	3769575768	4.3785919804283315
Malintka-Rep1-3hr-37C-self_2	26281254	12605520	26281254	3942188100	15214709	3771656121	4.325820449815675
Malintka-Rep1-8hr-25C-self_1	22686228	10644841	22686228	3402934200	12486280	3146767815	7.527808942059473
Malintka-Rep1-8hr-25C-self_2	22686228	10722240	22686228	3402934200	4886387	3150968970	7.4043521029586765
Malintka-Rep1-8hr-37C-self_1	26484041	12481115	26484041	3972606150	12557206	3778894192	4.8761933774884785
Malintka-Rep1-8hr-37C-self_2	26484041	12674924	26484041	3972606150	20709862	3788363136	4.637837405553028
Malintka-Rep2-0hr-25C-self_1	28500088	13875770	28500088	4275013200	13360585	4054795055	5.151285731702536
Malintka-Rep2-0hr-25C-self_2	28500088	14512833	28500088	4275013200	15263027	4057390529	5.090573077060908
Malintka-Rep2-3hr-25C-self_1	27919406	13241387	27919406	4187910900	11303707	3965337534	5.314663356376565
Malintka-Rep2-3hr-25C-self_2	27919406	13748076	27919406	4187910900	12413016	3964178025	5.342350406738596
Malintka-Rep2-3hr-37C-self_1	25768408	10199922	25768408	3865261200	6312609	3789838058	1.9513077667299692
Malintka-Rep2-3hr-37C-self_2	25768408	10422568	25768408	3865261200	14125763	3784458301	2.090490003625111
Malintka-Rep2-8hr-25C-self_1	25446065	11612491	25446065	3816909750	8357845	3646372942	4.467928747856823
Malintka-Rep2-8hr-25C-self_2	25446065	11992321	25446065	3816909750	9422969	3664302582	3.998186438649748
Malintka-Rep2-8hr-37C-self_1	26549366	11776850	26549366	3982404900	13050632	3825985520	3.927761840590343
Malintka-Rep2-8hr-37C-self_2	26549366	11961441	26549366	3982404900	18874450	3847448283	3.3888220908928672
Malintka-Rep3-0hr-25C-self_1	24570403	10645060	24570403	3685560450	6066442	3584998955	2.728526539294722
Malintka-Rep3-0hr-25C-self_2	24570403	10900644	24570403	3685560450	9427462	3587236985	2.667802260576136
Malintka-Rep3-3hr-25C-self_1	26649510	11405440	26649510	3997426500	8610334	3888725873	2.7192651822366214
Malintka-Rep3-3hr-25C-self_2	26649510	11686490	26649510	3997426500	16554800	3889070118	2.7106535167063113
Malintka-Rep3-3hr-37C-self_1	24906918	10977403	24906918	3736037700	11489636	3566480996	4.538409877394973
Malintka-Rep3-3hr-37C-self_2	24906918	11109684	24906918	3736037700	10922206	3567987556	4.498084802516848
Malintka-Rep3-8hr-25C-self_1	25630399	10914547	25630399	3844559850	8232023	3730815903	2.958568768281758
Malintka-Rep3-8hr-25C-self_2	25630399	11157689	25630399	3844559850	13685144	3733299072	2.893979606013937
Malintka-Rep3-8hr-37C-self_1	29880320	12928253	29880320	4482048000	13375403	4341551074	3.1346591111920263
Malintka-Rep3-8hr-37C-self_2	29880320	13201745	29880320	4482048000	28524231	4331767725	3.3529376526088077
Nagcarlang-Rep1-0hr-25C-self_1	26100599	12416700	26100599	3915089850	17312250	3682196031	5.948620029754872
Nagcarlang-Rep1-0hr-25C-self_2	26100599	12542273	26100599	3915089850	19166876	3706616323	5.324872097124412
Nagcarlang-Rep1-3hr-25C-self_1	25374486	10372152	25374486	3806172900	5388601	3722440133	2.199920213818978
Nagcarlang-Rep1-3hr-25C-self_2	25374486	10676106	25374486	3806172900	12182120	3724434091	2.147532735572785
Nagcarlang-Rep1-3hr-37C-self_1	22241133	10286555	22241133	3336169950	5224040	3167433357	5.057793683442296
Nagcarlang-Rep1-3hr-37C-self_2	22241133	10401448	22241133	3336169950	5173912	3186983233	4.47179607861404
Nagcarlang-Rep1-8hr-25C-self_1	24191732	9915781	24191732	3628759800	3751378	3554399848	2.049183635687322
Nagcarlang-Rep1-8hr-25C-self_2	24191732	10252231	24191732	3628759800	5866719	3560923256	1.8694140075074683
Nagcarlang-Rep1-8hr-37C-self_1	25622877	11226833	25622877	3843431550	7601603	3712421372	3.4086772795524354
Nagcarlang-Rep1-8hr-37C-self_2	25622877	11490771	25622877	3843431550	12434184	3727115169	3.0263679601630997
Nagcarlang-Rep2-0hr-25C-self_1	25935043	11680810	25935043	3890256450	9138119	3744644331	3.7429953750221276
Nagcarlang-Rep2-0hr-25C-self_2	25935043	11884352	25935043	3890256450	15272745	3758082045	3.397575627694159
Nagcarlang-Rep2-3hr-25C-self_1	25900288	12034252	25900288	3885043200	11025504	3650383687	6.040074740996445
Nagcarlang-Rep2-3hr-25C-self_2	25900288	12191256	25900288	3885043200	13296146	3658671727	5.8267427502479245
Nagcarlang-Rep2-3hr-37C-self_1	25526648	10882833	25526648	3828997200	7527530	3709142016	3.130197744725434
Nagcarlang-Rep2-3hr-37C-self_2	25526648	11207394	25526648	3828997200	12233561	3728241699	2.631380900461353
Nagcarlang-Rep2-8hr-25C-self_1	26152001	11021120	26152001	3922800150	7338839	3808495368	2.9138568784851304
Nagcarlang-Rep2-8hr-25C-self_2	26152001	11417637	26152001	3922800150	14161646	3806966230	2.952837656029966
Nagcarlang-Rep2-8hr-37C-self_1	30136968	14048744	30136968	4520545200	27503672	4254873078	5.8769929343920735
Nagcarlang-Rep2-8hr-37C-self_2	30136968	14205399	30136968	4520545200	40555995	4281436673	5.289373657849943
Nagcarlang-Rep3-0hr-25C-self_1	26182850	11573762	26182850	3927427500	10387240	3744436081	4.659320102026072
Nagcarlang-Rep3-0hr-25C-self_2	26182850	11795673	26182850	3927427500	15341564	3752530401	4.453222853891002
Nagcarlang-Rep3-3hr-25C-self_1	28800688	13636683	28800688	4320103200	24623760	4068395349	5.826431438026758
Nagcarlang-Rep3-3hr-25C-self_2	28800688	13841854	28800688	4320103200	35842273	4098750532	5.123781950394148
Nagcarlang-Rep3-3hr-37C-self_1	29053499	12851942	29053499	4358024850	17671948	4189320491	3.8711197114904015
Nagcarlang-Rep3-3hr-37C-self_2	29053499	13210773	29053499	4358024850	31084650	4203161155	3.553529415969255
Nagcarlang-Rep3-8hr-25C-self_1	26337374	11377908	26337374	3950606100	9091942	3824858984	3.1829828845756096
Nagcarlang-Rep3-8hr-25C-self_2	26337374	11636697	26337374	3950606100	16856897	3839644647	2.8087197303725118
Nagcarlang-Rep3-8hr-37C-self_1	28347760	13109760	28347760	4252164000	20364955	4026831353	5.299246383723675
Nagcarlang-Rep3-8hr-37C-self_2	28347760	13249159	28347760	4252164000	32777376	4048822950	4.78206038149046
Tamaulipas-Rep1-0hr-25C-self_1	24653161	11226672	24653161	3697974150	9357855	3475588140	6.013725379881306
Tamaulipas-Rep1-0hr-25C-self_2	24653161	11291443	24653161	3697974150	9817802	3484652417	5.768610713517291
Tamaulipas-Rep1-3hr-25C-self_1	27887974	11971287	27887974	4183196100	12486685	4044362673	3.3188362123401287
Tamaulipas-Rep1-3hr-25C-self_2	27887974	12241372	27887974	4183196100	24000916	4059539195	2.9560389244004126
Tamaulipas-Rep1-3hr-37C-self_1	25373054	11421275	25373054	3805958100	10342034	3620297988	4.878143876570791
Tamaulipas-Rep1-3hr-37C-self_2	25373054	11349159	25373054	3805958100	15621549	3675338334	3.431981187601619
Tamaulipas-Rep1-8hr-25C-self_1	25572228	11047272	25572228	3835834200	10370583	3689747154	3.808481763888544
Tamaulipas-Rep1-8hr-25C-self_2	25572228	11106958	25572228	3835834200	16289616	3730446339	2.747456107461579
Tamaulipas-Rep1-8hr-37C-self_1	25168246	10831722	25168246	3775236900	7993626	3629039925	3.8725245295202533
Tamaulipas-Rep1-8hr-37C-self_2	25168246	10820422	25168246	3775236900	13344651	3675029806	2.654325984152147
Tamaulipas-Rep2-0hr-25C-self_1	26062579	12209444	26062579	3909386850	17692774	3669239594	6.142836849210766
Tamaulipas-Rep2-0hr-25C-self_2	26062579	12105475	26062579	3909386850	24053036	3735582200	4.445828890021462
Tamaulipas-Rep2-3hr-25C-self_1	26417669	12317782	26417669	3962650350	16456030	3728333545	5.913133491578433
Tamaulipas-Rep2-3hr-25C-self_2	26417669	12276556	26417669	3962650350	22614280	3791457506	4.320160218021759
Tamaulipas-Rep2-3hr-37C-self_1	23699103	10529313	23699103	3554865450	4433806	3416687818	3.8870003363981045
Tamaulipas-Rep2-3hr-37C-self_2	23699103	10617941	23699103	3554865450	6051829	3452928865	2.8675230169400647
Tamaulipas-Rep2-8hr-25C-self_1	29660303	11433763	29660303	4449045450	19597652	4362644769	1.9420049080415664
Tamaulipas-Rep2-8hr-25C-self_2	29660303	12101864	29660303	4449045450	48346739	4333179161	2.6042954674693197
Tamaulipas-Rep2-8hr-37C-self_1	26481774	11699425	26481774	3972266100	10106629	3815079637	3.9570980151606663
Tamaulipas-Rep2-8hr-37C-self_2	26481774	11940636	26481774	3972266100	19239094	3826181209	3.677620968041391
Tamaulipas-Rep3-0hr-25C-self_1	22106329	9934239	22106329	3315949350	4366471	3158301502	4.75422967482902
Tamaulipas-Rep3-0hr-25C-self_2	22106329	9976667	22106329	3315949350	5046468	3215291059	3.035579870965158
Tamaulipas-Rep3-3hr-25C-self_1	23235180	10084715	23235180	3485277000	5631718	3332137098	4.393909063755908
Tamaulipas-Rep3-3hr-25C-self_2	23235180	10020379	23235180	3485277000	6327872	3392860246	2.651632969201587
Tamaulipas-Rep3-3hr-37C-self_1	26909003	11678688	26909003	4036350450	5529063	3840668569	4.847990367139702
Tamaulipas-Rep3-3hr-37C-self_2	26909003	11387831	26909003	4036350450	6725741	3939078665	2.409894438179916
Tamaulipas-Rep3-8hr-25C-self_1	23916972	10078330	23916972	3587545800	4069316	3442658515	4.038618405930873
Tamaulipas-Rep3-8hr-25C-self_2	23916972	9856369	23916972	3587545800	6002461	3524387454	1.7604889113889501
Tamaulipas-Rep3-8hr-37C-self_1	22742788	10511258	22742788	3411418200	4403521	3267551030	4.21722467213196
Tamaulipas-Rep3-8hr-37C-self_2	22742788	10651746	22742788	3411418200	5530100	3293664016	3.4517663064587043